Protein–RNA interactions for Protein: Q60931

Vdac3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac3Q60931 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vdac3Q60931 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vdac3Q60931 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vdac3Q60931 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vdac3Q60931 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vdac3Q60931 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vdac3Q60931 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vdac3Q60931 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vdac3Q60931 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vdac3Q60931 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vdac3Q60931 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vdac3Q60931 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vdac3Q60931 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vdac3Q60931 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vdac3Q60931 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vdac3Q60931 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vdac3Q60931 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vdac3Q60931 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vdac3Q60931 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vdac3Q60931 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vdac3Q60931 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vdac3Q60931 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vdac3Q60931 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vdac3Q60931 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vdac3Q60931 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vdac3Q60931 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vdac3Q60931 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vdac3Q60931 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vdac3Q60931 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vdac3Q60931 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vdac3Q60931 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vdac3Q60931 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vdac3Q60931 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vdac3Q60931 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vdac3Q60931 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vdac3Q60931 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vdac3Q60931 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vdac3Q60931 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vdac3Q60931 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vdac3Q60931 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vdac3Q60931 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vdac3Q60931 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vdac3Q60931 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vdac3Q60931 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vdac3Q60931 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vdac3Q60931 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vdac3Q60931 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vdac3Q60931 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vdac3Q60931 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vdac3Q60931 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vdac3Q60931 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vdac3Q60931 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vdac3Q60931 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vdac3Q60931 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vdac3Q60931 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vdac3Q60931 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vdac3Q60931 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vdac3Q60931 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vdac3Q60931 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vdac3Q60931 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vdac3Q60931 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vdac3Q60931 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vdac3Q60931 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vdac3Q60931 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vdac3Q60931 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms