Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf8Q60846 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf8Q60846 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf8Q60846 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf8Q60846 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf8Q60846 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf8Q60846 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf8Q60846 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf8Q60846 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf8Q60846 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf8Q60846 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf8Q60846 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf8Q60846 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf8Q60846 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf8Q60846 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf8Q60846 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf8Q60846 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf8Q60846 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfrsf8Q60846 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfrsf8Q60846 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfrsf8Q60846 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf8Q60846 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf8Q60846 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf8Q60846 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf8Q60846 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf8Q60846 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf8Q60846 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf8Q60846 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf8Q60846 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf8Q60846 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf8Q60846 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf8Q60846 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf8Q60846 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf8Q60846 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf8Q60846 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf8Q60846 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf8Q60846 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf8Q60846 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfrsf8Q60846 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfrsf8Q60846 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfrsf8Q60846 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.8 ms