Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mkrn3Q60764 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mkrn3Q60764 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mkrn3Q60764 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mkrn3Q60764 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mkrn3Q60764 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mkrn3Q60764 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mkrn3Q60764 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mkrn3Q60764 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mkrn3Q60764 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mkrn3Q60764 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Mkrn3Q60764 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mkrn3Q60764 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mkrn3Q60764 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mkrn3Q60764 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mkrn3Q60764 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mkrn3Q60764 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mkrn3Q60764 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mkrn3Q60764 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mkrn3Q60764 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mkrn3Q60764 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mkrn3Q60764 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mkrn3Q60764 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mkrn3Q60764 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mkrn3Q60764 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mkrn3Q60764 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mkrn3Q60764 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mkrn3Q60764 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mkrn3Q60764 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mkrn3Q60764 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mkrn3Q60764 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mkrn3Q60764 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mkrn3Q60764 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mkrn3Q60764 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mkrn3Q60764 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mkrn3Q60764 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mkrn3Q60764 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mkrn3Q60764 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Mkrn3Q60764 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mkrn3Q60764 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mkrn3Q60764 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mkrn3Q60764 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mkrn3Q60764 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mkrn3Q60764 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Mkrn3Q60764 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mkrn3Q60764 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mkrn3Q60764 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mkrn3Q60764 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mkrn3Q60764 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mkrn3Q60764 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mkrn3Q60764 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mkrn3Q60764 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mkrn3Q60764 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mkrn3Q60764 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mkrn3Q60764 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mkrn3Q60764 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mkrn3Q60764 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mkrn3Q60764 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mkrn3Q60764 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mkrn3Q60764 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mkrn3Q60764 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mkrn3Q60764 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mkrn3Q60764 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mkrn3Q60764 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mkrn3Q60764 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mkrn3Q60764 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mkrn3Q60764 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mkrn3Q60764 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mkrn3Q60764 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mkrn3Q60764 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mkrn3Q60764 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mkrn3Q60764 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Mkrn3Q60764 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mkrn3Q60764 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mkrn3Q60764 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mkrn3Q60764 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mkrn3Q60764 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mkrn3Q60764 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mkrn3Q60764 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mkrn3Q60764 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mkrn3Q60764 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Mkrn3Q60764 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mkrn3Q60764 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mkrn3Q60764 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mkrn3Q60764 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mkrn3Q60764 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mkrn3Q60764 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mkrn3Q60764 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mkrn3Q60764 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mkrn3Q60764 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mkrn3Q60764 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mkrn3Q60764 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mkrn3Q60764 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mkrn3Q60764 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mkrn3Q60764 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mkrn3Q60764 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mkrn3Q60764 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mkrn3Q60764 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mkrn3Q60764 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Mkrn3Q60764 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms