Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcf4Q60722 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcf4Q60722 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcf4Q60722 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcf4Q60722 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcf4Q60722 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcf4Q60722 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcf4Q60722 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcf4Q60722 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcf4Q60722 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcf4Q60722 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcf4Q60722 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcf4Q60722 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcf4Q60722 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcf4Q60722 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcf4Q60722 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcf4Q60722 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcf4Q60722 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcf4Q60722 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcf4Q60722 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcf4Q60722 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcf4Q60722 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcf4Q60722 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tcf4Q60722 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcf4Q60722 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcf4Q60722 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcf4Q60722 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcf4Q60722 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcf4Q60722 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcf4Q60722 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcf4Q60722 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcf4Q60722 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcf4Q60722 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcf4Q60722 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcf4Q60722 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcf4Q60722 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcf4Q60722 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcf4Q60722 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcf4Q60722 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcf4Q60722 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcf4Q60722 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcf4Q60722 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcf4Q60722 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcf4Q60722 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcf4Q60722 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcf4Q60722 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcf4Q60722 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcf4Q60722 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcf4Q60722 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcf4Q60722 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcf4Q60722 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcf4Q60722 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcf4Q60722 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcf4Q60722 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcf4Q60722 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcf4Q60722 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcf4Q60722 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcf4Q60722 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcf4Q60722 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcf4Q60722 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcf4Q60722 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcf4Q60722 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcf4Q60722 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcf4Q60722 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcf4Q60722 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcf4Q60722 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcf4Q60722 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcf4Q60722 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcf4Q60722 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcf4Q60722 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcf4Q60722 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcf4Q60722 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcf4Q60722 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcf4Q60722 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcf4Q60722 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcf4Q60722 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms