Protein–RNA interactions for Protein: Q5UKY4

Cd200r3, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r3Q5UKY4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cd200r3Q5UKY4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd200r3Q5UKY4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd200r3Q5UKY4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd200r3Q5UKY4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd200r3Q5UKY4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd200r3Q5UKY4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd200r3Q5UKY4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd200r3Q5UKY4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd200r3Q5UKY4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd200r3Q5UKY4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd200r3Q5UKY4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd200r3Q5UKY4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd200r3Q5UKY4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd200r3Q5UKY4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd200r3Q5UKY4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd200r3Q5UKY4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd200r3Q5UKY4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd200r3Q5UKY4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd200r3Q5UKY4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd200r3Q5UKY4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd200r3Q5UKY4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd200r3Q5UKY4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd200r3Q5UKY4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd200r3Q5UKY4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd200r3Q5UKY4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms