Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Thoc6Q5U4D9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Thoc6Q5U4D9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Thoc6Q5U4D9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thoc6Q5U4D9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thoc6Q5U4D9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thoc6Q5U4D9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thoc6Q5U4D9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thoc6Q5U4D9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thoc6Q5U4D9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thoc6Q5U4D9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thoc6Q5U4D9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thoc6Q5U4D9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Thoc6Q5U4D9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Thoc6Q5U4D9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thoc6Q5U4D9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thoc6Q5U4D9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thoc6Q5U4D9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Thoc6Q5U4D9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Thoc6Q5U4D9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Thoc6Q5U4D9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Thoc6Q5U4D9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Thoc6Q5U4D9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Thoc6Q5U4D9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Thoc6Q5U4D9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thoc6Q5U4D9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thoc6Q5U4D9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thoc6Q5U4D9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Thoc6Q5U4D9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Thoc6Q5U4D9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Thoc6Q5U4D9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Thoc6Q5U4D9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Thoc6Q5U4D9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Thoc6Q5U4D9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Thoc6Q5U4D9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Thoc6Q5U4D9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Thoc6Q5U4D9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Thoc6Q5U4D9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Thoc6Q5U4D9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Thoc6Q5U4D9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thoc6Q5U4D9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thoc6Q5U4D9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thoc6Q5U4D9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thoc6Q5U4D9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Thoc6Q5U4D9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Thoc6Q5U4D9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Thoc6Q5U4D9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Thoc6Q5U4D9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Thoc6Q5U4D9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Thoc6Q5U4D9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Thoc6Q5U4D9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Thoc6Q5U4D9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Thoc6Q5U4D9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Thoc6Q5U4D9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Thoc6Q5U4D9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Thoc6Q5U4D9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Thoc6Q5U4D9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Thoc6Q5U4D9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Thoc6Q5U4D9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Thoc6Q5U4D9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Thoc6Q5U4D9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Thoc6Q5U4D9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Thoc6Q5U4D9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Thoc6Q5U4D9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Thoc6Q5U4D9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Thoc6Q5U4D9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Thoc6Q5U4D9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Thoc6Q5U4D9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Thoc6Q5U4D9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Thoc6Q5U4D9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Thoc6Q5U4D9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Thoc6Q5U4D9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Thoc6Q5U4D9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Thoc6Q5U4D9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Thoc6Q5U4D9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Thoc6Q5U4D9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Thoc6Q5U4D9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Thoc6Q5U4D9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Thoc6Q5U4D9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Thoc6Q5U4D9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Thoc6Q5U4D9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Thoc6Q5U4D9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms