Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zzef1Q5SSH7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Zzef1Q5SSH7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zzef1Q5SSH7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zzef1Q5SSH7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zzef1Q5SSH7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zzef1Q5SSH7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zzef1Q5SSH7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zzef1Q5SSH7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zzef1Q5SSH7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zzef1Q5SSH7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zzef1Q5SSH7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zzef1Q5SSH7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zzef1Q5SSH7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zzef1Q5SSH7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zzef1Q5SSH7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Zzef1Q5SSH7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Zzef1Q5SSH7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Zzef1Q5SSH7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zzef1Q5SSH7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zzef1Q5SSH7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zzef1Q5SSH7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zzef1Q5SSH7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zzef1Q5SSH7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zzef1Q5SSH7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zzef1Q5SSH7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zzef1Q5SSH7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zzef1Q5SSH7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zzef1Q5SSH7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zzef1Q5SSH7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zzef1Q5SSH7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zzef1Q5SSH7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zzef1Q5SSH7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zzef1Q5SSH7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zzef1Q5SSH7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zzef1Q5SSH7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zzef1Q5SSH7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Zzef1Q5SSH7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zzef1Q5SSH7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zzef1Q5SSH7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zzef1Q5SSH7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zzef1Q5SSH7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zzef1Q5SSH7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zzef1Q5SSH7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zzef1Q5SSH7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zzef1Q5SSH7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zzef1Q5SSH7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zzef1Q5SSH7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zzef1Q5SSH7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zzef1Q5SSH7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zzef1Q5SSH7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Zzef1Q5SSH7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zzef1Q5SSH7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Zzef1Q5SSH7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zzef1Q5SSH7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zzef1Q5SSH7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zzef1Q5SSH7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zzef1Q5SSH7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zzef1Q5SSH7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zzef1Q5SSH7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zzef1Q5SSH7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zzef1Q5SSH7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zzef1Q5SSH7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zzef1Q5SSH7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zzef1Q5SSH7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zzef1Q5SSH7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zzef1Q5SSH7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zzef1Q5SSH7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zzef1Q5SSH7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Zzef1Q5SSH7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zzef1Q5SSH7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zzef1Q5SSH7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Zzef1Q5SSH7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zzef1Q5SSH7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zzef1Q5SSH7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zzef1Q5SSH7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zzef1Q5SSH7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zzef1Q5SSH7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zzef1Q5SSH7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zzef1Q5SSH7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zzef1Q5SSH7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zzef1Q5SSH7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zzef1Q5SSH7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zzef1Q5SSH7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zzef1Q5SSH7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zzef1Q5SSH7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zzef1Q5SSH7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zzef1Q5SSH7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zzef1Q5SSH7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zzef1Q5SSH7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zzef1Q5SSH7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zzef1Q5SSH7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zzef1Q5SSH7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zzef1Q5SSH7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zzef1Q5SSH7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zzef1Q5SSH7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zzef1Q5SSH7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Zzef1Q5SSH7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zzef1Q5SSH7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zzef1Q5SSH7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.2 ms