Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trp53i11Q4QQM4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trp53i11Q4QQM4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trp53i11Q4QQM4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trp53i11Q4QQM4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trp53i11Q4QQM4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trp53i11Q4QQM4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trp53i11Q4QQM4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trp53i11Q4QQM4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trp53i11Q4QQM4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trp53i11Q4QQM4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trp53i11Q4QQM4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trp53i11Q4QQM4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trp53i11Q4QQM4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trp53i11Q4QQM4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trp53i11Q4QQM4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trp53i11Q4QQM4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trp53i11Q4QQM4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trp53i11Q4QQM4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trp53i11Q4QQM4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Trp53i11Q4QQM4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trp53i11Q4QQM4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trp53i11Q4QQM4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trp53i11Q4QQM4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trp53i11Q4QQM4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trp53i11Q4QQM4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trp53i11Q4QQM4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trp53i11Q4QQM4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trp53i11Q4QQM4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trp53i11Q4QQM4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trp53i11Q4QQM4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trp53i11Q4QQM4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trp53i11Q4QQM4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trp53i11Q4QQM4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trp53i11Q4QQM4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trp53i11Q4QQM4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trp53i11Q4QQM4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trp53i11Q4QQM4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trp53i11Q4QQM4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trp53i11Q4QQM4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trp53i11Q4QQM4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trp53i11Q4QQM4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trp53i11Q4QQM4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trp53i11Q4QQM4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trp53i11Q4QQM4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trp53i11Q4QQM4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trp53i11Q4QQM4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trp53i11Q4QQM4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trp53i11Q4QQM4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trp53i11Q4QQM4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trp53i11Q4QQM4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trp53i11Q4QQM4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trp53i11Q4QQM4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trp53i11Q4QQM4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trp53i11Q4QQM4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trp53i11Q4QQM4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trp53i11Q4QQM4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trp53i11Q4QQM4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trp53i11Q4QQM4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trp53i11Q4QQM4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trp53i11Q4QQM4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trp53i11Q4QQM4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trp53i11Q4QQM4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trp53i11Q4QQM4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trp53i11Q4QQM4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trp53i11Q4QQM4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trp53i11Q4QQM4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trp53i11Q4QQM4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trp53i11Q4QQM4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trp53i11Q4QQM4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trp53i11Q4QQM4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trp53i11Q4QQM4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trp53i11Q4QQM4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trp53i11Q4QQM4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms