Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pacs2Q3V3Q7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pacs2Q3V3Q7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pacs2Q3V3Q7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pacs2Q3V3Q7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pacs2Q3V3Q7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pacs2Q3V3Q7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pacs2Q3V3Q7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pacs2Q3V3Q7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pacs2Q3V3Q7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pacs2Q3V3Q7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pacs2Q3V3Q7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pacs2Q3V3Q7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pacs2Q3V3Q7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pacs2Q3V3Q7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pacs2Q3V3Q7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pacs2Q3V3Q7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pacs2Q3V3Q7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pacs2Q3V3Q7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pacs2Q3V3Q7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pacs2Q3V3Q7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pacs2Q3V3Q7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pacs2Q3V3Q7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pacs2Q3V3Q7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pacs2Q3V3Q7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacs2Q3V3Q7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacs2Q3V3Q7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacs2Q3V3Q7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacs2Q3V3Q7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacs2Q3V3Q7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacs2Q3V3Q7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacs2Q3V3Q7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacs2Q3V3Q7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacs2Q3V3Q7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacs2Q3V3Q7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pacs2Q3V3Q7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pacs2Q3V3Q7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pacs2Q3V3Q7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pacs2Q3V3Q7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pacs2Q3V3Q7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.3 ms