Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ckap2Q3V1H1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ckap2Q3V1H1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ckap2Q3V1H1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ckap2Q3V1H1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ckap2Q3V1H1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ckap2Q3V1H1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ckap2Q3V1H1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ckap2Q3V1H1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ckap2Q3V1H1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ckap2Q3V1H1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ckap2Q3V1H1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ckap2Q3V1H1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ckap2Q3V1H1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ckap2Q3V1H1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ckap2Q3V1H1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ckap2Q3V1H1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ckap2Q3V1H1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ckap2Q3V1H1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ckap2Q3V1H1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ckap2Q3V1H1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ckap2Q3V1H1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ckap2Q3V1H1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ckap2Q3V1H1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ckap2Q3V1H1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ckap2Q3V1H1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ckap2Q3V1H1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ckap2Q3V1H1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ckap2Q3V1H1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ckap2Q3V1H1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ckap2Q3V1H1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ckap2Q3V1H1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ckap2Q3V1H1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ckap2Q3V1H1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ckap2Q3V1H1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ckap2Q3V1H1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ckap2Q3V1H1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ckap2Q3V1H1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ckap2Q3V1H1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ckap2Q3V1H1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ckap2Q3V1H1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ckap2Q3V1H1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ckap2Q3V1H1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ckap2Q3V1H1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ckap2Q3V1H1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ckap2Q3V1H1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ckap2Q3V1H1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ckap2Q3V1H1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ckap2Q3V1H1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ckap2Q3V1H1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ckap2Q3V1H1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ckap2Q3V1H1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ckap2Q3V1H1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ckap2Q3V1H1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ckap2Q3V1H1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ckap2Q3V1H1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ckap2Q3V1H1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ckap2Q3V1H1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ckap2Q3V1H1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ckap2Q3V1H1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ckap2Q3V1H1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ckap2Q3V1H1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ckap2Q3V1H1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ckap2Q3V1H1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ckap2Q3V1H1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ckap2Q3V1H1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ckap2Q3V1H1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ckap2Q3V1H1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ckap2Q3V1H1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ckap2Q3V1H1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ckap2Q3V1H1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ckap2Q3V1H1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ckap2Q3V1H1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ckap2Q3V1H1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ckap2Q3V1H1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ckap2Q3V1H1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ckap2Q3V1H1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms