Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930596D02RikQ3V0H9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930596D02RikQ3V0H9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930596D02RikQ3V0H9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms