Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc27Q3V036 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc27Q3V036 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc27Q3V036 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc27Q3V036 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc27Q3V036 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc27Q3V036 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc27Q3V036 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc27Q3V036 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc27Q3V036 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc27Q3V036 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc27Q3V036 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc27Q3V036 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc27Q3V036 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc27Q3V036 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc27Q3V036 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc27Q3V036 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc27Q3V036 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc27Q3V036 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc27Q3V036 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc27Q3V036 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc27Q3V036 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc27Q3V036 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc27Q3V036 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc27Q3V036 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc27Q3V036 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc27Q3V036 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc27Q3V036 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc27Q3V036 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc27Q3V036 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc27Q3V036 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ccdc27Q3V036 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc27Q3V036 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc27Q3V036 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc27Q3V036 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc27Q3V036 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc27Q3V036 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc27Q3V036 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc27Q3V036 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc27Q3V036 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc27Q3V036 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc27Q3V036 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc27Q3V036 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc27Q3V036 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc27Q3V036 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc27Q3V036 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc27Q3V036 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc27Q3V036 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc27Q3V036 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc27Q3V036 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc27Q3V036 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc27Q3V036 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc27Q3V036 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc27Q3V036 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms