Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SvipQ3UZP4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SvipQ3UZP4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SvipQ3UZP4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SvipQ3UZP4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SvipQ3UZP4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SvipQ3UZP4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SvipQ3UZP4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SvipQ3UZP4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvipQ3UZP4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SvipQ3UZP4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvipQ3UZP4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvipQ3UZP4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvipQ3UZP4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SvipQ3UZP4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SvipQ3UZP4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SvipQ3UZP4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SvipQ3UZP4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
SvipQ3UZP4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SvipQ3UZP4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SvipQ3UZP4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SvipQ3UZP4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SvipQ3UZP4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SvipQ3UZP4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SvipQ3UZP4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SvipQ3UZP4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SvipQ3UZP4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SvipQ3UZP4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SvipQ3UZP4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SvipQ3UZP4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SvipQ3UZP4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SvipQ3UZP4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SvipQ3UZP4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SvipQ3UZP4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvipQ3UZP4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvipQ3UZP4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvipQ3UZP4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvipQ3UZP4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SvipQ3UZP4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SvipQ3UZP4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SvipQ3UZP4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SvipQ3UZP4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SvipQ3UZP4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms