Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc160Q3UYG1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc160Q3UYG1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc160Q3UYG1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc160Q3UYG1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc160Q3UYG1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc160Q3UYG1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc160Q3UYG1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc160Q3UYG1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc160Q3UYG1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc160Q3UYG1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc160Q3UYG1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc160Q3UYG1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc160Q3UYG1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc160Q3UYG1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc160Q3UYG1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc160Q3UYG1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc160Q3UYG1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc160Q3UYG1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc160Q3UYG1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc160Q3UYG1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc160Q3UYG1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc160Q3UYG1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc160Q3UYG1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms