Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Capn13Q3UW68 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Capn13Q3UW68 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Capn13Q3UW68 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Capn13Q3UW68 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Capn13Q3UW68 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Capn13Q3UW68 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Capn13Q3UW68 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Capn13Q3UW68 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capn13Q3UW68 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capn13Q3UW68 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capn13Q3UW68 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Capn13Q3UW68 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capn13Q3UW68 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capn13Q3UW68 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Capn13Q3UW68 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Capn13Q3UW68 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Capn13Q3UW68 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Capn13Q3UW68 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Capn13Q3UW68 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Capn13Q3UW68 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Capn13Q3UW68 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Capn13Q3UW68 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capn13Q3UW68 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capn13Q3UW68 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capn13Q3UW68 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capn13Q3UW68 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capn13Q3UW68 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capn13Q3UW68 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capn13Q3UW68 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capn13Q3UW68 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn13Q3UW68 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn13Q3UW68 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn13Q3UW68 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn13Q3UW68 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Capn13Q3UW68 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Capn13Q3UW68 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Capn13Q3UW68 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Capn13Q3UW68 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Capn13Q3UW68 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Capn13Q3UW68 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Capn13Q3UW68 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Capn13Q3UW68 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Capn13Q3UW68 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Capn13Q3UW68 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Capn13Q3UW68 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Capn13Q3UW68 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Capn13Q3UW68 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capn13Q3UW68 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Capn13Q3UW68 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capn13Q3UW68 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capn13Q3UW68 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn13Q3UW68 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn13Q3UW68 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn13Q3UW68 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn13Q3UW68 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn13Q3UW68 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn13Q3UW68 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn13Q3UW68 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn13Q3UW68 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn13Q3UW68 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn13Q3UW68 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn13Q3UW68 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn13Q3UW68 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn13Q3UW68 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn13Q3UW68 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn13Q3UW68 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn13Q3UW68 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Capn13Q3UW68 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn13Q3UW68 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn13Q3UW68 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn13Q3UW68 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn13Q3UW68 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capn13Q3UW68 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capn13Q3UW68 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capn13Q3UW68 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn13Q3UW68 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn13Q3UW68 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn13Q3UW68 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms