Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slfn4Q3UV66 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slfn4Q3UV66 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slfn4Q3UV66 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slfn4Q3UV66 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn4Q3UV66 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn4Q3UV66 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn4Q3UV66 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn4Q3UV66 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn4Q3UV66 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn4Q3UV66 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn4Q3UV66 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn4Q3UV66 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn4Q3UV66 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn4Q3UV66 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn4Q3UV66 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn4Q3UV66 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn4Q3UV66 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn4Q3UV66 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn4Q3UV66 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn4Q3UV66 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn4Q3UV66 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn4Q3UV66 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn4Q3UV66 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn4Q3UV66 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfn4Q3UV66 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfn4Q3UV66 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slfn4Q3UV66 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slfn4Q3UV66 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slfn4Q3UV66 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn4Q3UV66 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn4Q3UV66 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn4Q3UV66 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn4Q3UV66 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn4Q3UV66 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slfn4Q3UV66 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slfn4Q3UV66 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn4Q3UV66 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn4Q3UV66 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn4Q3UV66 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn4Q3UV66 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn4Q3UV66 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn4Q3UV66 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn4Q3UV66 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn4Q3UV66 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slfn4Q3UV66 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slfn4Q3UV66 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slfn4Q3UV66 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn4Q3UV66 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn4Q3UV66 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn4Q3UV66 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn4Q3UV66 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn4Q3UV66 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn4Q3UV66 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn4Q3UV66 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn4Q3UV66 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn4Q3UV66 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn4Q3UV66 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn4Q3UV66 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn4Q3UV66 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn4Q3UV66 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn4Q3UV66 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn4Q3UV66 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slfn4Q3UV66 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slfn4Q3UV66 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slfn4Q3UV66 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slfn4Q3UV66 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slfn4Q3UV66 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slfn4Q3UV66 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slfn4Q3UV66 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slfn4Q3UV66 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slfn4Q3UV66 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slfn4Q3UV66 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Slfn4Q3UV66 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slfn4Q3UV66 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slfn4Q3UV66 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slfn4Q3UV66 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slfn4Q3UV66 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slfn4Q3UV66 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slfn4Q3UV66 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slfn4Q3UV66 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slfn4Q3UV66 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slfn4Q3UV66 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slfn4Q3UV66 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slfn4Q3UV66 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slfn4Q3UV66 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slfn4Q3UV66 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slfn4Q3UV66 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slfn4Q3UV66 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slfn4Q3UV66 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slfn4Q3UV66 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slfn4Q3UV66 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slfn4Q3UV66 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slfn4Q3UV66 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slfn4Q3UV66 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slfn4Q3UV66 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slfn4Q3UV66 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slfn4Q3UV66 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slfn4Q3UV66 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slfn4Q3UV66 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1650.9 ms