Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TceancQ3US16 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TceancQ3US16 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TceancQ3US16 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TceancQ3US16 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TceancQ3US16 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TceancQ3US16 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TceancQ3US16 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TceancQ3US16 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TceancQ3US16 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TceancQ3US16 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TceancQ3US16 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TceancQ3US16 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TceancQ3US16 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TceancQ3US16 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TceancQ3US16 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TceancQ3US16 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TceancQ3US16 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TceancQ3US16 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TceancQ3US16 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TceancQ3US16 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TceancQ3US16 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TceancQ3US16 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TceancQ3US16 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TceancQ3US16 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TceancQ3US16 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TceancQ3US16 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TceancQ3US16 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TceancQ3US16 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TceancQ3US16 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TceancQ3US16 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TceancQ3US16 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TceancQ3US16 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TceancQ3US16 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TceancQ3US16 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TceancQ3US16 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TceancQ3US16 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TceancQ3US16 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TceancQ3US16 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TceancQ3US16 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TceancQ3US16 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TceancQ3US16 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TceancQ3US16 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TceancQ3US16 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TceancQ3US16 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TceancQ3US16 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TceancQ3US16 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TceancQ3US16 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TceancQ3US16 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TceancQ3US16 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TceancQ3US16 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TceancQ3US16 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TceancQ3US16 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TceancQ3US16 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TceancQ3US16 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TceancQ3US16 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TceancQ3US16 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TceancQ3US16 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TceancQ3US16 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TceancQ3US16 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TceancQ3US16 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TceancQ3US16 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TceancQ3US16 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TceancQ3US16 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TceancQ3US16 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TceancQ3US16 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TceancQ3US16 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TceancQ3US16 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TceancQ3US16 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TceancQ3US16 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TceancQ3US16 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TceancQ3US16 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TceancQ3US16 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TceancQ3US16 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TceancQ3US16 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TceancQ3US16 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TceancQ3US16 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TceancQ3US16 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TceancQ3US16 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TceancQ3US16 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TceancQ3US16 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TceancQ3US16 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TceancQ3US16 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TceancQ3US16 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TceancQ3US16 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TceancQ3US16 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TceancQ3US16 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TceancQ3US16 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TceancQ3US16 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TceancQ3US16 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TceancQ3US16 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TceancQ3US16 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TceancQ3US16 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TceancQ3US16 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TceancQ3US16 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TceancQ3US16 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TceancQ3US16 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TceancQ3US16 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TceancQ3US16 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TceancQ3US16 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.3 ms