Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam83fQ3UKU4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam83fQ3UKU4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam83fQ3UKU4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam83fQ3UKU4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam83fQ3UKU4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam83fQ3UKU4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam83fQ3UKU4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam83fQ3UKU4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam83fQ3UKU4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam83fQ3UKU4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam83fQ3UKU4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam83fQ3UKU4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam83fQ3UKU4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam83fQ3UKU4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam83fQ3UKU4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam83fQ3UKU4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam83fQ3UKU4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam83fQ3UKU4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam83fQ3UKU4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam83fQ3UKU4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam83fQ3UKU4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam83fQ3UKU4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam83fQ3UKU4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam83fQ3UKU4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam83fQ3UKU4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam83fQ3UKU4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam83fQ3UKU4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam83fQ3UKU4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam83fQ3UKU4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam83fQ3UKU4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam83fQ3UKU4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam83fQ3UKU4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam83fQ3UKU4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam83fQ3UKU4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam83fQ3UKU4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam83fQ3UKU4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam83fQ3UKU4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam83fQ3UKU4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam83fQ3UKU4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam83fQ3UKU4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam83fQ3UKU4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam83fQ3UKU4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam83fQ3UKU4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam83fQ3UKU4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam83fQ3UKU4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam83fQ3UKU4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam83fQ3UKU4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam83fQ3UKU4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam83fQ3UKU4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam83fQ3UKU4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam83fQ3UKU4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam83fQ3UKU4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam83fQ3UKU4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam83fQ3UKU4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam83fQ3UKU4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam83fQ3UKU4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam83fQ3UKU4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms