Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gpr55Q3UJF0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gpr55Q3UJF0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gpr55Q3UJF0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gpr55Q3UJF0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gpr55Q3UJF0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gpr55Q3UJF0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gpr55Q3UJF0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gpr55Q3UJF0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gpr55Q3UJF0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gpr55Q3UJF0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gpr55Q3UJF0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpr55Q3UJF0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpr55Q3UJF0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gpr55Q3UJF0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gpr55Q3UJF0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gpr55Q3UJF0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gpr55Q3UJF0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gpr55Q3UJF0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gpr55Q3UJF0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gpr55Q3UJF0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpr55Q3UJF0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpr55Q3UJF0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpr55Q3UJF0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpr55Q3UJF0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpr55Q3UJF0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpr55Q3UJF0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpr55Q3UJF0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpr55Q3UJF0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpr55Q3UJF0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpr55Q3UJF0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpr55Q3UJF0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpr55Q3UJF0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpr55Q3UJF0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpr55Q3UJF0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpr55Q3UJF0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpr55Q3UJF0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpr55Q3UJF0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpr55Q3UJF0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpr55Q3UJF0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpr55Q3UJF0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpr55Q3UJF0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpr55Q3UJF0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gpr55Q3UJF0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms