Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmed8Q3UHI4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tmed8Q3UHI4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Tmed8Q3UHI4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tmed8Q3UHI4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tmed8Q3UHI4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Tmed8Q3UHI4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tmed8Q3UHI4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tmed8Q3UHI4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Tmed8Q3UHI4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tmed8Q3UHI4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tmed8Q3UHI4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tmed8Q3UHI4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tmed8Q3UHI4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tmed8Q3UHI4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmed8Q3UHI4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmed8Q3UHI4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmed8Q3UHI4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmed8Q3UHI4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmed8Q3UHI4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmed8Q3UHI4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmed8Q3UHI4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmed8Q3UHI4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmed8Q3UHI4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmed8Q3UHI4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tmed8Q3UHI4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tmed8Q3UHI4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tmed8Q3UHI4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tmed8Q3UHI4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tmed8Q3UHI4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Tmed8Q3UHI4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Tmed8Q3UHI4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tmed8Q3UHI4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tmed8Q3UHI4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Tmed8Q3UHI4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tmed8Q3UHI4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tmed8Q3UHI4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tmed8Q3UHI4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmed8Q3UHI4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmed8Q3UHI4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmed8Q3UHI4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmed8Q3UHI4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tmed8Q3UHI4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tmed8Q3UHI4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tmed8Q3UHI4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tmed8Q3UHI4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tmed8Q3UHI4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tmed8Q3UHI4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tmed8Q3UHI4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tmed8Q3UHI4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tmed8Q3UHI4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tmed8Q3UHI4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tmed8Q3UHI4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tmed8Q3UHI4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tmed8Q3UHI4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tmed8Q3UHI4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tmed8Q3UHI4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tmed8Q3UHI4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tmed8Q3UHI4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tmed8Q3UHI4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tmed8Q3UHI4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Tmed8Q3UHI4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmed8Q3UHI4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmed8Q3UHI4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmed8Q3UHI4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tmed8Q3UHI4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tmed8Q3UHI4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tmed8Q3UHI4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tmed8Q3UHI4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tmed8Q3UHI4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Tmed8Q3UHI4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tmed8Q3UHI4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Tmed8Q3UHI4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tmed8Q3UHI4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tmed8Q3UHI4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tmed8Q3UHI4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tmed8Q3UHI4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tmed8Q3UHI4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmed8Q3UHI4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmed8Q3UHI4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmed8Q3UHI4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmed8Q3UHI4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmed8Q3UHI4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tmed8Q3UHI4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tmed8Q3UHI4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tmed8Q3UHI4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmed8Q3UHI4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms