Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF7

Hivep2, Transcription factor HIVEP2, mousemouse

Predictions only

Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep2Q3UHF7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hivep2Q3UHF7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hivep2Q3UHF7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hivep2Q3UHF7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hivep2Q3UHF7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hivep2Q3UHF7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hivep2Q3UHF7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hivep2Q3UHF7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hivep2Q3UHF7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hivep2Q3UHF7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hivep2Q3UHF7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hivep2Q3UHF7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hivep2Q3UHF7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hivep2Q3UHF7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hivep2Q3UHF7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hivep2Q3UHF7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hivep2Q3UHF7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hivep2Q3UHF7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hivep2Q3UHF7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hivep2Q3UHF7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hivep2Q3UHF7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hivep2Q3UHF7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hivep2Q3UHF7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hivep2Q3UHF7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hivep2Q3UHF7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hivep2Q3UHF7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms