Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rsph3aQ3UFY4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rsph3aQ3UFY4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rsph3aQ3UFY4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rsph3aQ3UFY4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rsph3aQ3UFY4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rsph3aQ3UFY4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rsph3aQ3UFY4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rsph3aQ3UFY4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rsph3aQ3UFY4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rsph3aQ3UFY4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rsph3aQ3UFY4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsph3aQ3UFY4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsph3aQ3UFY4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsph3aQ3UFY4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsph3aQ3UFY4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsph3aQ3UFY4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsph3aQ3UFY4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsph3aQ3UFY4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsph3aQ3UFY4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsph3aQ3UFY4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsph3aQ3UFY4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsph3aQ3UFY4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsph3aQ3UFY4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rsph3aQ3UFY4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rsph3aQ3UFY4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rsph3aQ3UFY4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rsph3aQ3UFY4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsph3aQ3UFY4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsph3aQ3UFY4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsph3aQ3UFY4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rsph3aQ3UFY4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsph3aQ3UFY4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsph3aQ3UFY4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsph3aQ3UFY4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsph3aQ3UFY4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rsph3aQ3UFY4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rsph3aQ3UFY4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rsph3aQ3UFY4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rsph3aQ3UFY4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rsph3aQ3UFY4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rsph3aQ3UFY4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rsph3aQ3UFY4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rsph3aQ3UFY4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rsph3aQ3UFY4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rsph3aQ3UFY4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsph3aQ3UFY4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsph3aQ3UFY4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsph3aQ3UFY4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsph3aQ3UFY4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rsph3aQ3UFY4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rsph3aQ3UFY4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rsph3aQ3UFY4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rsph3aQ3UFY4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rsph3aQ3UFY4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rsph3aQ3UFY4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rsph3aQ3UFY4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rsph3aQ3UFY4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rsph3aQ3UFY4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rsph3aQ3UFY4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rsph3aQ3UFY4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rsph3aQ3UFY4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rsph3aQ3UFY4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rsph3aQ3UFY4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rsph3aQ3UFY4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rsph3aQ3UFY4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rsph3aQ3UFY4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rsph3aQ3UFY4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Rsph3aQ3UFY4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rsph3aQ3UFY4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rsph3aQ3UFY4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rsph3aQ3UFY4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rsph3aQ3UFY4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rsph3aQ3UFY4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rsph3aQ3UFY4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rsph3aQ3UFY4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms