Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDN3

Gm45902, Predicted gene 45902, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45902Q3UDN3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm45902Q3UDN3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm45902Q3UDN3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm45902Q3UDN3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm45902Q3UDN3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm45902Q3UDN3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm45902Q3UDN3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm45902Q3UDN3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm45902Q3UDN3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm45902Q3UDN3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm45902Q3UDN3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm45902Q3UDN3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm45902Q3UDN3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm45902Q3UDN3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm45902Q3UDN3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm45902Q3UDN3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm45902Q3UDN3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm45902Q3UDN3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm45902Q3UDN3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm45902Q3UDN3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm45902Q3UDN3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm45902Q3UDN3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm45902Q3UDN3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm45902Q3UDN3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm45902Q3UDN3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm45902Q3UDN3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm45902Q3UDN3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm45902Q3UDN3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm45902Q3UDN3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm45902Q3UDN3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm45902Q3UDN3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm45902Q3UDN3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm45902Q3UDN3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm45902Q3UDN3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm45902Q3UDN3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm45902Q3UDN3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm45902Q3UDN3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm45902Q3UDN3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm45902Q3UDN3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm45902Q3UDN3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm45902Q3UDN3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm45902Q3UDN3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm45902Q3UDN3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm45902Q3UDN3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm45902Q3UDN3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm45902Q3UDN3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm45902Q3UDN3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm45902Q3UDN3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm45902Q3UDN3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm45902Q3UDN3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm45902Q3UDN3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm45902Q3UDN3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm45902Q3UDN3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm45902Q3UDN3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm45902Q3UDN3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm45902Q3UDN3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm45902Q3UDN3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm45902Q3UDN3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm45902Q3UDN3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm45902Q3UDN3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm45902Q3UDN3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm45902Q3UDN3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
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