Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rnf180Q3U827 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnf180Q3U827 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnf180Q3U827 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rnf180Q3U827 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rnf180Q3U827 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rnf180Q3U827 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rnf180Q3U827 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rnf180Q3U827 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnf180Q3U827 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnf180Q3U827 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnf180Q3U827 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rnf180Q3U827 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Rnf180Q3U827 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rnf180Q3U827 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf180Q3U827 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf180Q3U827 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf180Q3U827 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnf180Q3U827 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnf180Q3U827 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnf180Q3U827 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnf180Q3U827 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rnf180Q3U827 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Rnf180Q3U827 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Rnf180Q3U827 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rnf180Q3U827 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Rnf180Q3U827 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rnf180Q3U827 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rnf180Q3U827 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rnf180Q3U827 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rnf180Q3U827 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rnf180Q3U827 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rnf180Q3U827 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rnf180Q3U827 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rnf180Q3U827 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Rnf180Q3U827 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rnf180Q3U827 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rnf180Q3U827 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rnf180Q3U827 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rnf180Q3U827 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Rnf180Q3U827 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rnf180Q3U827 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rnf180Q3U827 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rnf180Q3U827 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rnf180Q3U827 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rnf180Q3U827 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rnf180Q3U827 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Rnf180Q3U827 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rnf180Q3U827 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Rnf180Q3U827 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rnf180Q3U827 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rnf180Q3U827 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rnf180Q3U827 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rnf180Q3U827 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rnf180Q3U827 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rnf180Q3U827 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rnf180Q3U827 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rnf180Q3U827 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rnf180Q3U827 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf180Q3U827 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf180Q3U827 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf180Q3U827 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf180Q3U827 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rnf180Q3U827 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rnf180Q3U827 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rnf180Q3U827 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rnf180Q3U827 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rnf180Q3U827 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Rnf180Q3U827 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rnf180Q3U827 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rnf180Q3U827 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rnf180Q3U827 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rnf180Q3U827 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rnf180Q3U827 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
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