Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6Q4

Pik3r6, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3r6Q3U6Q4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pik3r6Q3U6Q4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pik3r6Q3U6Q4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pik3r6Q3U6Q4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pik3r6Q3U6Q4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pik3r6Q3U6Q4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pik3r6Q3U6Q4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pik3r6Q3U6Q4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pik3r6Q3U6Q4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pik3r6Q3U6Q4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pik3r6Q3U6Q4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pik3r6Q3U6Q4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pik3r6Q3U6Q4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pik3r6Q3U6Q4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pik3r6Q3U6Q4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pik3r6Q3U6Q4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pik3r6Q3U6Q4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pik3r6Q3U6Q4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pik3r6Q3U6Q4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pik3r6Q3U6Q4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pik3r6Q3U6Q4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pik3r6Q3U6Q4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pik3r6Q3U6Q4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pik3r6Q3U6Q4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pik3r6Q3U6Q4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3r6Q3U6Q4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3r6Q3U6Q4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3r6Q3U6Q4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pik3r6Q3U6Q4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pik3r6Q3U6Q4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pik3r6Q3U6Q4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pik3r6Q3U6Q4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pik3r6Q3U6Q4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pik3r6Q3U6Q4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pik3r6Q3U6Q4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pik3r6Q3U6Q4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pik3r6Q3U6Q4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pik3r6Q3U6Q4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pik3r6Q3U6Q4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pik3r6Q3U6Q4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pik3r6Q3U6Q4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pik3r6Q3U6Q4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pik3r6Q3U6Q4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pik3r6Q3U6Q4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pik3r6Q3U6Q4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pik3r6Q3U6Q4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pik3r6Q3U6Q4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3r6Q3U6Q4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3r6Q3U6Q4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3r6Q3U6Q4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3r6Q3U6Q4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3r6Q3U6Q4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3r6Q3U6Q4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3r6Q3U6Q4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3r6Q3U6Q4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3r6Q3U6Q4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3r6Q3U6Q4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3r6Q3U6Q4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3r6Q3U6Q4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3r6Q3U6Q4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3r6Q3U6Q4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3r6Q3U6Q4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3r6Q3U6Q4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3r6Q3U6Q4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pik3r6Q3U6Q4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pik3r6Q3U6Q4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pik3r6Q3U6Q4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pik3r6Q3U6Q4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pik3r6Q3U6Q4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pik3r6Q3U6Q4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pik3r6Q3U6Q4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pik3r6Q3U6Q4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pik3r6Q3U6Q4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pik3r6Q3U6Q4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pik3r6Q3U6Q4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pik3r6Q3U6Q4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pik3r6Q3U6Q4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms