Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam193bQ3U2K0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Fam193bQ3U2K0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam193bQ3U2K0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam193bQ3U2K0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam193bQ3U2K0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam193bQ3U2K0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam193bQ3U2K0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam193bQ3U2K0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam193bQ3U2K0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam193bQ3U2K0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam193bQ3U2K0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam193bQ3U2K0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam193bQ3U2K0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Fam193bQ3U2K0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam193bQ3U2K0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam193bQ3U2K0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam193bQ3U2K0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam193bQ3U2K0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam193bQ3U2K0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam193bQ3U2K0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam193bQ3U2K0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam193bQ3U2K0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam193bQ3U2K0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam193bQ3U2K0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam193bQ3U2K0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam193bQ3U2K0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam193bQ3U2K0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam193bQ3U2K0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam193bQ3U2K0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam193bQ3U2K0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam193bQ3U2K0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam193bQ3U2K0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam193bQ3U2K0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam193bQ3U2K0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam193bQ3U2K0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam193bQ3U2K0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam193bQ3U2K0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam193bQ3U2K0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam193bQ3U2K0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fam193bQ3U2K0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam193bQ3U2K0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam193bQ3U2K0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam193bQ3U2K0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam193bQ3U2K0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam193bQ3U2K0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam193bQ3U2K0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam193bQ3U2K0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam193bQ3U2K0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam193bQ3U2K0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam193bQ3U2K0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam193bQ3U2K0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam193bQ3U2K0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam193bQ3U2K0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam193bQ3U2K0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam193bQ3U2K0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam193bQ3U2K0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam193bQ3U2K0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam193bQ3U2K0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam193bQ3U2K0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam193bQ3U2K0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam193bQ3U2K0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.1 ms