Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700066B19RikQ3TS39 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700066B19RikQ3TS39 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700066B19RikQ3TS39 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700066B19RikQ3TS39 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700066B19RikQ3TS39 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700066B19RikQ3TS39 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700066B19RikQ3TS39 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700066B19RikQ3TS39 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700066B19RikQ3TS39 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700066B19RikQ3TS39 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700066B19RikQ3TS39 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
1700066B19RikQ3TS39 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700066B19RikQ3TS39 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700066B19RikQ3TS39 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700066B19RikQ3TS39 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700066B19RikQ3TS39 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700066B19RikQ3TS39 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700066B19RikQ3TS39 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
1700066B19RikQ3TS39 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700066B19RikQ3TS39 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700066B19RikQ3TS39 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700066B19RikQ3TS39 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700066B19RikQ3TS39 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700066B19RikQ3TS39 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700066B19RikQ3TS39 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700066B19RikQ3TS39 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700066B19RikQ3TS39 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700066B19RikQ3TS39 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700066B19RikQ3TS39 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700066B19RikQ3TS39 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700066B19RikQ3TS39 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700066B19RikQ3TS39 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700066B19RikQ3TS39 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700066B19RikQ3TS39 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700066B19RikQ3TS39 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700066B19RikQ3TS39 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700066B19RikQ3TS39 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700066B19RikQ3TS39 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
1700066B19RikQ3TS39 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
1700066B19RikQ3TS39 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700066B19RikQ3TS39 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700066B19RikQ3TS39 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700066B19RikQ3TS39 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700066B19RikQ3TS39 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700066B19RikQ3TS39 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700066B19RikQ3TS39 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700066B19RikQ3TS39 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700066B19RikQ3TS39 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700066B19RikQ3TS39 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700066B19RikQ3TS39 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700066B19RikQ3TS39 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
1700066B19RikQ3TS39 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700066B19RikQ3TS39 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700066B19RikQ3TS39 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700066B19RikQ3TS39 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700066B19RikQ3TS39 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700066B19RikQ3TS39 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700066B19RikQ3TS39 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700066B19RikQ3TS39 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700066B19RikQ3TS39 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
1700066B19RikQ3TS39 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
1700066B19RikQ3TS39 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700066B19RikQ3TS39 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700066B19RikQ3TS39 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700066B19RikQ3TS39 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700066B19RikQ3TS39 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700066B19RikQ3TS39 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700066B19RikQ3TS39 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700066B19RikQ3TS39 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700066B19RikQ3TS39 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700066B19RikQ3TS39 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700066B19RikQ3TS39 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700066B19RikQ3TS39 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700066B19RikQ3TS39 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1700066B19RikQ3TS39 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms