Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM8

Hk3, Hexokinase-3, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hk3Q3TRM8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hk3Q3TRM8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hk3Q3TRM8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hk3Q3TRM8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hk3Q3TRM8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hk3Q3TRM8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hk3Q3TRM8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hk3Q3TRM8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hk3Q3TRM8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hk3Q3TRM8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hk3Q3TRM8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hk3Q3TRM8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hk3Q3TRM8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hk3Q3TRM8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hk3Q3TRM8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hk3Q3TRM8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hk3Q3TRM8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hk3Q3TRM8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hk3Q3TRM8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hk3Q3TRM8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hk3Q3TRM8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hk3Q3TRM8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hk3Q3TRM8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hk3Q3TRM8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hk3Q3TRM8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hk3Q3TRM8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hk3Q3TRM8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hk3Q3TRM8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hk3Q3TRM8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hk3Q3TRM8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hk3Q3TRM8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hk3Q3TRM8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hk3Q3TRM8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hk3Q3TRM8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hk3Q3TRM8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hk3Q3TRM8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hk3Q3TRM8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hk3Q3TRM8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hk3Q3TRM8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hk3Q3TRM8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hk3Q3TRM8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hk3Q3TRM8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hk3Q3TRM8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hk3Q3TRM8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hk3Q3TRM8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hk3Q3TRM8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hk3Q3TRM8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hk3Q3TRM8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hk3Q3TRM8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hk3Q3TRM8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hk3Q3TRM8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hk3Q3TRM8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Hk3Q3TRM8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hk3Q3TRM8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hk3Q3TRM8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hk3Q3TRM8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hk3Q3TRM8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hk3Q3TRM8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hk3Q3TRM8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hk3Q3TRM8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hk3Q3TRM8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hk3Q3TRM8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hk3Q3TRM8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hk3Q3TRM8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hk3Q3TRM8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hk3Q3TRM8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hk3Q3TRM8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hk3Q3TRM8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hk3Q3TRM8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hk3Q3TRM8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hk3Q3TRM8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hk3Q3TRM8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hk3Q3TRM8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hk3Q3TRM8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hk3Q3TRM8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms