Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ctdnep1Q3TP92 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ctdnep1Q3TP92 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ctdnep1Q3TP92 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ctdnep1Q3TP92 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ctdnep1Q3TP92 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ctdnep1Q3TP92 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ctdnep1Q3TP92 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ctdnep1Q3TP92 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ctdnep1Q3TP92 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ctdnep1Q3TP92 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ctdnep1Q3TP92 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ctdnep1Q3TP92 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ctdnep1Q3TP92 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ctdnep1Q3TP92 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ctdnep1Q3TP92 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ctdnep1Q3TP92 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ctdnep1Q3TP92 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ctdnep1Q3TP92 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ctdnep1Q3TP92 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ctdnep1Q3TP92 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ctdnep1Q3TP92 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ctdnep1Q3TP92 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ctdnep1Q3TP92 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ctdnep1Q3TP92 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ctdnep1Q3TP92 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ctdnep1Q3TP92 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ctdnep1Q3TP92 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ctdnep1Q3TP92 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ctdnep1Q3TP92 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ctdnep1Q3TP92 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ctdnep1Q3TP92 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ctdnep1Q3TP92 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ctdnep1Q3TP92 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ctdnep1Q3TP92 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ctdnep1Q3TP92 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ctdnep1Q3TP92 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ctdnep1Q3TP92 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ctdnep1Q3TP92 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ctdnep1Q3TP92 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ctdnep1Q3TP92 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ctdnep1Q3TP92 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ctdnep1Q3TP92 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ctdnep1Q3TP92 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ctdnep1Q3TP92 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ctdnep1Q3TP92 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ctdnep1Q3TP92 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ctdnep1Q3TP92 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ctdnep1Q3TP92 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ctdnep1Q3TP92 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ctdnep1Q3TP92 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ctdnep1Q3TP92 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ctdnep1Q3TP92 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ctdnep1Q3TP92 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ctdnep1Q3TP92 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ctdnep1Q3TP92 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ctdnep1Q3TP92 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ctdnep1Q3TP92 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ctdnep1Q3TP92 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ctdnep1Q3TP92 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ctdnep1Q3TP92 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ctdnep1Q3TP92 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1Q3TP92 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1Q3TP92 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ctdnep1Q3TP92 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ctdnep1Q3TP92 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ctdnep1Q3TP92 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ctdnep1Q3TP92 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ctdnep1Q3TP92 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ctdnep1Q3TP92 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ctdnep1Q3TP92 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ctdnep1Q3TP92 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ctdnep1Q3TP92 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ctdnep1Q3TP92 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ctdnep1Q3TP92 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ctdnep1Q3TP92 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms