Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdgfl1Q2VPR5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdgfl1Q2VPR5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdgfl1Q2VPR5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdgfl1Q2VPR5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdgfl1Q2VPR5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdgfl1Q2VPR5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdgfl1Q2VPR5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdgfl1Q2VPR5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdgfl1Q2VPR5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdgfl1Q2VPR5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdgfl1Q2VPR5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdgfl1Q2VPR5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdgfl1Q2VPR5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdgfl1Q2VPR5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdgfl1Q2VPR5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdgfl1Q2VPR5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdgfl1Q2VPR5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdgfl1Q2VPR5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdgfl1Q2VPR5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdgfl1Q2VPR5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdgfl1Q2VPR5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdgfl1Q2VPR5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdgfl1Q2VPR5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdgfl1Q2VPR5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdgfl1Q2VPR5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdgfl1Q2VPR5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdgfl1Q2VPR5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdgfl1Q2VPR5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdgfl1Q2VPR5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdgfl1Q2VPR5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdgfl1Q2VPR5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdgfl1Q2VPR5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hdgfl1Q2VPR5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdgfl1Q2VPR5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hdgfl1Q2VPR5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hdgfl1Q2VPR5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdgfl1Q2VPR5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdgfl1Q2VPR5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdgfl1Q2VPR5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdgfl1Q2VPR5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdgfl1Q2VPR5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdgfl1Q2VPR5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms