Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp8Q2V6D6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp8Q2V6D6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gbp8Q2V6D6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gbp8Q2V6D6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gbp8Q2V6D6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp8Q2V6D6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp8Q2V6D6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp8Q2V6D6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp8Q2V6D6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp8Q2V6D6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp8Q2V6D6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp8Q2V6D6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp8Q2V6D6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp8Q2V6D6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp8Q2V6D6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp8Q2V6D6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbp8Q2V6D6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbp8Q2V6D6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp8Q2V6D6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms