Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rspo3Q2TJ95 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rspo3Q2TJ95 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rspo3Q2TJ95 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rspo3Q2TJ95 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rspo3Q2TJ95 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rspo3Q2TJ95 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rspo3Q2TJ95 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rspo3Q2TJ95 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rspo3Q2TJ95 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rspo3Q2TJ95 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rspo3Q2TJ95 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rspo3Q2TJ95 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rspo3Q2TJ95 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rspo3Q2TJ95 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rspo3Q2TJ95 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rspo3Q2TJ95 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rspo3Q2TJ95 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rspo3Q2TJ95 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rspo3Q2TJ95 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rspo3Q2TJ95 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rspo3Q2TJ95 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rspo3Q2TJ95 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rspo3Q2TJ95 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rspo3Q2TJ95 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rspo3Q2TJ95 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rspo3Q2TJ95 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rspo3Q2TJ95 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rspo3Q2TJ95 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rspo3Q2TJ95 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rspo3Q2TJ95 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rspo3Q2TJ95 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rspo3Q2TJ95 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rspo3Q2TJ95 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rspo3Q2TJ95 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rspo3Q2TJ95 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rspo3Q2TJ95 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rspo3Q2TJ95 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rspo3Q2TJ95 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rspo3Q2TJ95 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rspo3Q2TJ95 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rspo3Q2TJ95 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rspo3Q2TJ95 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rspo3Q2TJ95 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rspo3Q2TJ95 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rspo3Q2TJ95 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rspo3Q2TJ95 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rspo3Q2TJ95 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms