Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vax1Q2NKI2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Vax1Q2NKI2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vax1Q2NKI2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vax1Q2NKI2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vax1Q2NKI2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vax1Q2NKI2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vax1Q2NKI2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vax1Q2NKI2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vax1Q2NKI2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vax1Q2NKI2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vax1Q2NKI2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vax1Q2NKI2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vax1Q2NKI2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vax1Q2NKI2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vax1Q2NKI2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vax1Q2NKI2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vax1Q2NKI2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vax1Q2NKI2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vax1Q2NKI2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vax1Q2NKI2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vax1Q2NKI2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vax1Q2NKI2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vax1Q2NKI2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Vax1Q2NKI2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vax1Q2NKI2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vax1Q2NKI2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vax1Q2NKI2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vax1Q2NKI2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vax1Q2NKI2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vax1Q2NKI2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vax1Q2NKI2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vax1Q2NKI2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Vax1Q2NKI2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vax1Q2NKI2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vax1Q2NKI2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vax1Q2NKI2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vax1Q2NKI2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vax1Q2NKI2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vax1Q2NKI2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vax1Q2NKI2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vax1Q2NKI2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vax1Q2NKI2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vax1Q2NKI2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vax1Q2NKI2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vax1Q2NKI2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vax1Q2NKI2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vax1Q2NKI2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vax1Q2NKI2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vax1Q2NKI2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Vax1Q2NKI2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vax1Q2NKI2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Vax1Q2NKI2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vax1Q2NKI2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vax1Q2NKI2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vax1Q2NKI2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vax1Q2NKI2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vax1Q2NKI2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vax1Q2NKI2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vax1Q2NKI2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vax1Q2NKI2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Vax1Q2NKI2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vax1Q2NKI2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vax1Q2NKI2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vax1Q2NKI2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vax1Q2NKI2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vax1Q2NKI2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Vax1Q2NKI2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vax1Q2NKI2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vax1Q2NKI2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vax1Q2NKI2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vax1Q2NKI2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms