Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ptchd1Q14B62 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ptchd1Q14B62 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ptchd1Q14B62 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ptchd1Q14B62 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ptchd1Q14B62 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ptchd1Q14B62 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ptchd1Q14B62 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ptchd1Q14B62 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ptchd1Q14B62 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ptchd1Q14B62 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ptchd1Q14B62 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ptchd1Q14B62 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ptchd1Q14B62 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ptchd1Q14B62 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ptchd1Q14B62 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ptchd1Q14B62 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ptchd1Q14B62 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ptchd1Q14B62 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ptchd1Q14B62 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ptchd1Q14B62 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ptchd1Q14B62 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ptchd1Q14B62 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ptchd1Q14B62 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ptchd1Q14B62 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ptchd1Q14B62 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ptchd1Q14B62 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms