Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lingo4Q149C3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lingo4Q149C3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lingo4Q149C3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lingo4Q149C3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lingo4Q149C3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lingo4Q149C3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lingo4Q149C3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lingo4Q149C3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lingo4Q149C3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lingo4Q149C3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lingo4Q149C3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lingo4Q149C3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lingo4Q149C3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lingo4Q149C3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lingo4Q149C3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lingo4Q149C3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lingo4Q149C3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lingo4Q149C3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lingo4Q149C3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lingo4Q149C3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Lingo4Q149C3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lingo4Q149C3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lingo4Q149C3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lingo4Q149C3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lingo4Q149C3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lingo4Q149C3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lingo4Q149C3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lingo4Q149C3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lingo4Q149C3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lingo4Q149C3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lingo4Q149C3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Lingo4Q149C3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lingo4Q149C3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lingo4Q149C3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lingo4Q149C3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lingo4Q149C3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lingo4Q149C3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lingo4Q149C3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lingo4Q149C3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lingo4Q149C3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lingo4Q149C3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lingo4Q149C3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lingo4Q149C3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lingo4Q149C3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lingo4Q149C3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lingo4Q149C3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lingo4Q149C3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lingo4Q149C3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lingo4Q149C3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lingo4Q149C3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lingo4Q149C3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lingo4Q149C3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lingo4Q149C3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lingo4Q149C3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lingo4Q149C3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lingo4Q149C3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lingo4Q149C3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lingo4Q149C3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lingo4Q149C3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lingo4Q149C3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lingo4Q149C3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lingo4Q149C3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lingo4Q149C3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lingo4Q149C3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lingo4Q149C3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lingo4Q149C3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lingo4Q149C3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lingo4Q149C3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lingo4Q149C3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lingo4Q149C3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lingo4Q149C3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lingo4Q149C3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lingo4Q149C3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lingo4Q149C3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lingo4Q149C3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lingo4Q149C3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms