Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smim24Q0VG18 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smim24Q0VG18 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smim24Q0VG18 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smim24Q0VG18 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smim24Q0VG18 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim24Q0VG18 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim24Q0VG18 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim24Q0VG18 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim24Q0VG18 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smim24Q0VG18 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smim24Q0VG18 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smim24Q0VG18 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim24Q0VG18 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim24Q0VG18 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim24Q0VG18 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim24Q0VG18 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim24Q0VG18 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smim24Q0VG18 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smim24Q0VG18 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smim24Q0VG18 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smim24Q0VG18 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smim24Q0VG18 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smim24Q0VG18 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smim24Q0VG18 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smim24Q0VG18 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smim24Q0VG18 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smim24Q0VG18 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smim24Q0VG18 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms