Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Vps8Q0P5W1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Vps8Q0P5W1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Vps8Q0P5W1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Vps8Q0P5W1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Vps8Q0P5W1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Vps8Q0P5W1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Vps8Q0P5W1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Vps8Q0P5W1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Vps8Q0P5W1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Vps8Q0P5W1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Vps8Q0P5W1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Vps8Q0P5W1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Vps8Q0P5W1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Vps8Q0P5W1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Vps8Q0P5W1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Vps8Q0P5W1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Vps8Q0P5W1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Vps8Q0P5W1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Vps8Q0P5W1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Vps8Q0P5W1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Vps8Q0P5W1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Vps8Q0P5W1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Vps8Q0P5W1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Vps8Q0P5W1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Vps8Q0P5W1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Vps8Q0P5W1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Vps8Q0P5W1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Vps8Q0P5W1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Vps8Q0P5W1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Vps8Q0P5W1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Vps8Q0P5W1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Vps8Q0P5W1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Vps8Q0P5W1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Vps8Q0P5W1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Vps8Q0P5W1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Vps8Q0P5W1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Vps8Q0P5W1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Vps8Q0P5W1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Vps8Q0P5W1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Vps8Q0P5W1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Vps8Q0P5W1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Vps8Q0P5W1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Vps8Q0P5W1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Vps8Q0P5W1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Vps8Q0P5W1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Vps8Q0P5W1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Vps8Q0P5W1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Vps8Q0P5W1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Vps8Q0P5W1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Vps8Q0P5W1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Vps8Q0P5W1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Vps8Q0P5W1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Vps8Q0P5W1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Vps8Q0P5W1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Vps8Q0P5W1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Vps8Q0P5W1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Vps8Q0P5W1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Vps8Q0P5W1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Vps8Q0P5W1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Vps8Q0P5W1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Vps8Q0P5W1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Vps8Q0P5W1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Vps8Q0P5W1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Vps8Q0P5W1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Vps8Q0P5W1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Vps8Q0P5W1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Vps8Q0P5W1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Vps8Q0P5W1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Vps8Q0P5W1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Vps8Q0P5W1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Vps8Q0P5W1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Vps8Q0P5W1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Vps8Q0P5W1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Vps8Q0P5W1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Vps8Q0P5W1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Vps8Q0P5W1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Vps8Q0P5W1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Vps8Q0P5W1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Vps8Q0P5W1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Vps8Q0P5W1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Vps8Q0P5W1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Vps8Q0P5W1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Vps8Q0P5W1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Vps8Q0P5W1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
Vps8Q0P5W1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
Vps8Q0P5W1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Vps8Q0P5W1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Vps8Q0P5W1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Vps8Q0P5W1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Vps8Q0P5W1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Vps8Q0P5W1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Vps8Q0P5W1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Vps8Q0P5W1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Vps8Q0P5W1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Vps8Q0P5W1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Vps8Q0P5W1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Vps8Q0P5W1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Vps8Q0P5W1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Vps8Q0P5W1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms