Protein–RNA interactions for Protein: Q0EEE2

Ptchd3, Patched domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptchd3Q0EEE2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptchd3Q0EEE2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ptchd3Q0EEE2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptchd3Q0EEE2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptchd3Q0EEE2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptchd3Q0EEE2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptchd3Q0EEE2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptchd3Q0EEE2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptchd3Q0EEE2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptchd3Q0EEE2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptchd3Q0EEE2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptchd3Q0EEE2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptchd3Q0EEE2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms