Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cass4Q08EC4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cass4Q08EC4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cass4Q08EC4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cass4Q08EC4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cass4Q08EC4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cass4Q08EC4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cass4Q08EC4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cass4Q08EC4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cass4Q08EC4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cass4Q08EC4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cass4Q08EC4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cass4Q08EC4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cass4Q08EC4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cass4Q08EC4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cass4Q08EC4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cass4Q08EC4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cass4Q08EC4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cass4Q08EC4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cass4Q08EC4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cass4Q08EC4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cass4Q08EC4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cass4Q08EC4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cass4Q08EC4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cass4Q08EC4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cass4Q08EC4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cass4Q08EC4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cass4Q08EC4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cass4Q08EC4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cass4Q08EC4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cass4Q08EC4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cass4Q08EC4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cass4Q08EC4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cass4Q08EC4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cass4Q08EC4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cass4Q08EC4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cass4Q08EC4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cass4Q08EC4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cass4Q08EC4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cass4Q08EC4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cass4Q08EC4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cass4Q08EC4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cass4Q08EC4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cass4Q08EC4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cass4Q08EC4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cass4Q08EC4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cass4Q08EC4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cass4Q08EC4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cass4Q08EC4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cass4Q08EC4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cass4Q08EC4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cass4Q08EC4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cass4Q08EC4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cass4Q08EC4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cass4Q08EC4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cass4Q08EC4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cass4Q08EC4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cass4Q08EC4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cass4Q08EC4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cass4Q08EC4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cass4Q08EC4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cass4Q08EC4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cass4Q08EC4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cass4Q08EC4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cass4Q08EC4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cass4Q08EC4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cass4Q08EC4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cass4Q08EC4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cass4Q08EC4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cass4Q08EC4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cass4Q08EC4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cass4Q08EC4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cass4Q08EC4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cass4Q08EC4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cass4Q08EC4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cass4Q08EC4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cass4Q08EC4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cass4Q08EC4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cass4Q08EC4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cass4Q08EC4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cass4Q08EC4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cass4Q08EC4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cass4Q08EC4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cass4Q08EC4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cass4Q08EC4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cass4Q08EC4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cass4Q08EC4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cass4Q08EC4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cass4Q08EC4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cass4Q08EC4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cass4Q08EC4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cass4Q08EC4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cass4Q08EC4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms