Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnn2Q08093 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Cnn2Q08093 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cnn2Q08093 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cnn2Q08093 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cnn2Q08093 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cnn2Q08093 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cnn2Q08093 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cnn2Q08093 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cnn2Q08093 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnn2Q08093 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnn2Q08093 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnn2Q08093 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cnn2Q08093 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnn2Q08093 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnn2Q08093 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cnn2Q08093 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnn2Q08093 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cnn2Q08093 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cnn2Q08093 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cnn2Q08093 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnn2Q08093 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms