Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MestQ07646 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MestQ07646 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MestQ07646 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MestQ07646 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MestQ07646 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MestQ07646 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MestQ07646 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MestQ07646 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MestQ07646 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MestQ07646 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MestQ07646 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MestQ07646 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MestQ07646 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MestQ07646 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MestQ07646 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MestQ07646 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MestQ07646 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MestQ07646 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MestQ07646 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MestQ07646 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MestQ07646 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MestQ07646 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MestQ07646 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MestQ07646 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MestQ07646 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MestQ07646 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MestQ07646 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MestQ07646 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MestQ07646 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MestQ07646 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MestQ07646 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MestQ07646 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MestQ07646 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MestQ07646 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MestQ07646 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MestQ07646 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MestQ07646 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MestQ07646 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MestQ07646 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MestQ07646 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MestQ07646 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MestQ07646 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MestQ07646 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MestQ07646 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MestQ07646 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MestQ07646 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MestQ07646 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MestQ07646 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MestQ07646 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MestQ07646 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MestQ07646 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MestQ07646 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MestQ07646 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MestQ07646 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MestQ07646 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MestQ07646 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MestQ07646 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MestQ07646 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MestQ07646 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MestQ07646 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MestQ07646 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MestQ07646 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MestQ07646 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MestQ07646 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MestQ07646 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MestQ07646 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MestQ07646 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MestQ07646 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MestQ07646 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MestQ07646 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MestQ07646 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MestQ07646 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MestQ07646 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MestQ07646 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MestQ07646 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MestQ07646 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MestQ07646 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MestQ07646 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MestQ07646 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MestQ07646 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MestQ07646 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MestQ07646 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MestQ07646 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MestQ07646 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MestQ07646 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MestQ07646 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MestQ07646 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MestQ07646 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MestQ07646 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MestQ07646 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MestQ07646 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MestQ07646 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MestQ07646 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MestQ07646 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MestQ07646 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MestQ07646 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MestQ07646 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MestQ07646 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MestQ07646 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms