Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atf4Q06507 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atf4Q06507 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Atf4Q06507 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atf4Q06507 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atf4Q06507 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atf4Q06507 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atf4Q06507 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atf4Q06507 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atf4Q06507 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf4Q06507 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf4Q06507 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf4Q06507 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atf4Q06507 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atf4Q06507 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atf4Q06507 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atf4Q06507 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf4Q06507 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf4Q06507 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf4Q06507 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf4Q06507 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atf4Q06507 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atf4Q06507 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atf4Q06507 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atf4Q06507 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atf4Q06507 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atf4Q06507 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf4Q06507 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf4Q06507 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atf4Q06507 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atf4Q06507 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atf4Q06507 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atf4Q06507 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atf4Q06507 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atf4Q06507 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atf4Q06507 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atf4Q06507 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atf4Q06507 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atf4Q06507 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atf4Q06507 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atf4Q06507 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atf4Q06507 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atf4Q06507 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf4Q06507 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms