Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Thbs3Q05895 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Thbs3Q05895 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Thbs3Q05895 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Thbs3Q05895 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Thbs3Q05895 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Thbs3Q05895 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Thbs3Q05895 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Thbs3Q05895 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Thbs3Q05895 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Thbs3Q05895 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Thbs3Q05895 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Thbs3Q05895 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Thbs3Q05895 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Thbs3Q05895 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Thbs3Q05895 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Thbs3Q05895 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Thbs3Q05895 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Thbs3Q05895 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Thbs3Q05895 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thbs3Q05895 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thbs3Q05895 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thbs3Q05895 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thbs3Q05895 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thbs3Q05895 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thbs3Q05895 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thbs3Q05895 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Thbs3Q05895 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Thbs3Q05895 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Thbs3Q05895 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Thbs3Q05895 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Thbs3Q05895 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Thbs3Q05895 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Thbs3Q05895 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Thbs3Q05895 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Thbs3Q05895 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Thbs3Q05895 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Thbs3Q05895 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Thbs3Q05895 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Thbs3Q05895 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Thbs3Q05895 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thbs3Q05895 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thbs3Q05895 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thbs3Q05895 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thbs3Q05895 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thbs3Q05895 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thbs3Q05895 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thbs3Q05895 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thbs3Q05895 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thbs3Q05895 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thbs3Q05895 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms