Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GscQ02591 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GscQ02591 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GscQ02591 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GscQ02591 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GscQ02591 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GscQ02591 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GscQ02591 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GscQ02591 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GscQ02591 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GscQ02591 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GscQ02591 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GscQ02591 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GscQ02591 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GscQ02591 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GscQ02591 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GscQ02591 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GscQ02591 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GscQ02591 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GscQ02591 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GscQ02591 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GscQ02591 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GscQ02591 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GscQ02591 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GscQ02591 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GscQ02591 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GscQ02591 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GscQ02591 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GscQ02591 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GscQ02591 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GscQ02591 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GscQ02591 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GscQ02591 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GscQ02591 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GscQ02591 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GscQ02591 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GscQ02591 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GscQ02591 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GscQ02591 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GscQ02591 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GscQ02591 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GscQ02591 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GscQ02591 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GscQ02591 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GscQ02591 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GscQ02591 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GscQ02591 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GscQ02591 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GscQ02591 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GscQ02591 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GscQ02591 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GscQ02591 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GscQ02591 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GscQ02591 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GscQ02591 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GscQ02591 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GscQ02591 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GscQ02591 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GscQ02591 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GscQ02591 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GscQ02591 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GscQ02591 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GscQ02591 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GscQ02591 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GscQ02591 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GscQ02591 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GscQ02591 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GscQ02591 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GscQ02591 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GscQ02591 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GscQ02591 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GscQ02591 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GscQ02591 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GscQ02591 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GscQ02591 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GscQ02591 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GscQ02591 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GscQ02591 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GscQ02591 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GscQ02591 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GscQ02591 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GscQ02591 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GscQ02591 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GscQ02591 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GscQ02591 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GscQ02591 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GscQ02591 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GscQ02591 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GscQ02591 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GscQ02591 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GscQ02591 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GscQ02591 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GscQ02591 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GscQ02591 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GscQ02591 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GscQ02591 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GscQ02591 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GscQ02591 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GscQ02591 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GscQ02591 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms