Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mc1rQ01727 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mc1rQ01727 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mc1rQ01727 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mc1rQ01727 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mc1rQ01727 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mc1rQ01727 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mc1rQ01727 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mc1rQ01727 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mc1rQ01727 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mc1rQ01727 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Mc1rQ01727 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mc1rQ01727 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Mc1rQ01727 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mc1rQ01727 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mc1rQ01727 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mc1rQ01727 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mc1rQ01727 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mc1rQ01727 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mc1rQ01727 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mc1rQ01727 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mc1rQ01727 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mc1rQ01727 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mc1rQ01727 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mc1rQ01727 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mc1rQ01727 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mc1rQ01727 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mc1rQ01727 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mc1rQ01727 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mc1rQ01727 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mc1rQ01727 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mc1rQ01727 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mc1rQ01727 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mc1rQ01727 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mc1rQ01727 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mc1rQ01727 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mc1rQ01727 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mc1rQ01727 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mc1rQ01727 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mc1rQ01727 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mc1rQ01727 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mc1rQ01727 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mc1rQ01727 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mc1rQ01727 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mc1rQ01727 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Mc1rQ01727 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mc1rQ01727 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mc1rQ01727 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mc1rQ01727 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mc1rQ01727 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mc1rQ01727 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms