Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Col1a2Q01149 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Col1a2Q01149 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col1a2Q01149 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Col1a2Q01149 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Col1a2Q01149 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col1a2Q01149 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col1a2Q01149 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Col1a2Q01149 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Col1a2Q01149 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Col1a2Q01149 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Col1a2Q01149 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col1a2Q01149 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Col1a2Q01149 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Col1a2Q01149 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Col1a2Q01149 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col1a2Q01149 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Col1a2Q01149 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Col1a2Q01149 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Col1a2Q01149 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Col1a2Q01149 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Col1a2Q01149 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Col1a2Q01149 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Col1a2Q01149 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Col1a2Q01149 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Col1a2Q01149 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Col1a2Q01149 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Col1a2Q01149 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Col1a2Q01149 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Col1a2Q01149 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col1a2Q01149 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col1a2Q01149 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col1a2Q01149 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col1a2Q01149 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col1a2Q01149 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col1a2Q01149 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Col1a2Q01149 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Col1a2Q01149 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Col1a2Q01149 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Col1a2Q01149 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Col1a2Q01149 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Col1a2Q01149 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Col1a2Q01149 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Col1a2Q01149 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Col1a2Q01149 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Col1a2Q01149 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Col1a2Q01149 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col1a2Q01149 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Col1a2Q01149 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col1a2Q01149 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Col1a2Q01149 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Col1a2Q01149 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Col1a2Q01149 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Col1a2Q01149 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col1a2Q01149 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col1a2Q01149 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Col1a2Q01149 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Col1a2Q01149 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Col1a2Q01149 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Col1a2Q01149 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Col1a2Q01149 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Col1a2Q01149 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Col1a2Q01149 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Col1a2Q01149 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 249.1 ms