Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin2cQ01098 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin2cQ01098 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin2cQ01098 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin2cQ01098 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2cQ01098 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2cQ01098 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2cQ01098 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2cQ01098 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2cQ01098 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2cQ01098 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2cQ01098 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2cQ01098 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grin2cQ01098 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2cQ01098 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2cQ01098 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2cQ01098 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2cQ01098 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2cQ01098 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin2cQ01098 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin2cQ01098 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grin2cQ01098 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin2cQ01098 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin2cQ01098 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin2cQ01098 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin2cQ01098 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin2cQ01098 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grin2cQ01098 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Grin2cQ01098 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grin2cQ01098 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Grin2cQ01098 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grin2cQ01098 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grin2cQ01098 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grin2cQ01098 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grin2cQ01098 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin2cQ01098 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin2cQ01098 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grin2cQ01098 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin2cQ01098 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin2cQ01098 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin2cQ01098 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin2cQ01098 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin2cQ01098 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin2cQ01098 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin2cQ01098 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin2cQ01098 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin2cQ01098 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin2cQ01098 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin2cQ01098 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grin2cQ01098 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2cQ01098 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2cQ01098 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2cQ01098 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2cQ01098 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin2cQ01098 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grin2cQ01098 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grin2cQ01098 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grin2cQ01098 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grin2cQ01098 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grin2cQ01098 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grin2cQ01098 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2cQ01098 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2cQ01098 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2cQ01098 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2cQ01098 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2cQ01098 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2cQ01098 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin2cQ01098 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin2cQ01098 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grin2cQ01098 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grin2cQ01098 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms