Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabpb1Q00420 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabpb1Q00420 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabpb1Q00420 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabpb1Q00420 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabpb1Q00420 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gabpb1Q00420 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gabpb1Q00420 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gabpb1Q00420 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gabpb1Q00420 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gabpb1Q00420 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gabpb1Q00420 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gabpb1Q00420 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabpb1Q00420 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabpb1Q00420 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabpb1Q00420 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabpb1Q00420 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabpb1Q00420 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gabpb1Q00420 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gabpb1Q00420 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gabpb1Q00420 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gabpb1Q00420 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabpb1Q00420 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabpb1Q00420 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabpb1Q00420 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabpb1Q00420 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabpb1Q00420 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gabpb1Q00420 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gabpb1Q00420 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gabpb1Q00420 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gabpb1Q00420 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gabpb1Q00420 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gabpb1Q00420 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gabpb1Q00420 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gabpb1Q00420 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabpb1Q00420 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabpb1Q00420 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabpb1Q00420 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabpb1Q00420 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gabpb1Q00420 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gabpb1Q00420 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabpb1Q00420 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabpb1Q00420 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabpb1Q00420 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabpb1Q00420 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabpb1Q00420 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabpb1Q00420 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabpb1Q00420 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabpb1Q00420 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabpb1Q00420 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabpb1Q00420 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabpb1Q00420 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gabpb1Q00420 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gabpb1Q00420 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gabpb1Q00420 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabpb1Q00420 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabpb1Q00420 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabpb1Q00420 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabpb1Q00420 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabpb1Q00420 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabpb1Q00420 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabpb1Q00420 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabpb1Q00420 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabpb1Q00420 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabpb1Q00420 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabpb1Q00420 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gabpb1Q00420 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gabpb1Q00420 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gabpb1Q00420 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gabpb1Q00420 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabpb1Q00420 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabpb1Q00420 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabpb1Q00420 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms