Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gata5P97489 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gata5P97489 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gata5P97489 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gata5P97489 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gata5P97489 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gata5P97489 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gata5P97489 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gata5P97489 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gata5P97489 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gata5P97489 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gata5P97489 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gata5P97489 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gata5P97489 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gata5P97489 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gata5P97489 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gata5P97489 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gata5P97489 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gata5P97489 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gata5P97489 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gata5P97489 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gata5P97489 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gata5P97489 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gata5P97489 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gata5P97489 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gata5P97489 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gata5P97489 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gata5P97489 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gata5P97489 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gata5P97489 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gata5P97489 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gata5P97489 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gata5P97489 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gata5P97489 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gata5P97489 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gata5P97489 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gata5P97489 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gata5P97489 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gata5P97489 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gata5P97489 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gata5P97489 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gata5P97489 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gata5P97489 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gata5P97489 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gata5P97489 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gata5P97489 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gata5P97489 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gata5P97489 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gata5P97489 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gata5P97489 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gata5P97489 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gata5P97489 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms