Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pkp1P97350 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pkp1P97350 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Pkp1P97350 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pkp1P97350 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pkp1P97350 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pkp1P97350 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pkp1P97350 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pkp1P97350 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pkp1P97350 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pkp1P97350 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkp1P97350 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Pkp1P97350 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pkp1P97350 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pkp1P97350 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pkp1P97350 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pkp1P97350 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pkp1P97350 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pkp1P97350 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkp1P97350 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkp1P97350 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkp1P97350 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkp1P97350 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pkp1P97350 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pkp1P97350 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pkp1P97350 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pkp1P97350 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pkp1P97350 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pkp1P97350 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pkp1P97350 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pkp1P97350 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pkp1P97350 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pkp1P97350 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pkp1P97350 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pkp1P97350 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pkp1P97350 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pkp1P97350 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pkp1P97350 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pkp1P97350 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pkp1P97350 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pkp1P97350 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pkp1P97350 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pkp1P97350 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pkp1P97350 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pkp1P97350 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Pkp1P97350 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pkp1P97350 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pkp1P97350 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pkp1P97350 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pkp1P97350 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pkp1P97350 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pkp1P97350 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pkp1P97350 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pkp1P97350 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pkp1P97350 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pkp1P97350 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pkp1P97350 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pkp1P97350 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pkp1P97350 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pkp1P97350 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pkp1P97350 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pkp1P97350 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pkp1P97350 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pkp1P97350 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pkp1P97350 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pkp1P97350 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pkp1P97350 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Pkp1P97350 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pkp1P97350 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pkp1P97350 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pkp1P97350 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pkp1P97350 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pkp1P97350 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pkp1P97350 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pkp1P97350 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pkp1P97350 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pkp1P97350 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms